蓝藻，又称"蓝细菌"，是一种广泛分布于全世界水体中的光能自养型原核生物，能进行光合作用和固氮作用。
　　在正常生态环境中,水体中蓝藻数量维持在正常范围，但人类活动的加剧以及对于水环境管理的缺乏造成了全球范围内的水体污染,其中以水体富营养化尤为严重,且有不断增加的趋势。水体富营养化对于生态环境具有严重的危害,而藻类水华现象就是其中之一。蓝藻在大量生长的同时,其次级代谢产物藻毒素也在水体环境中大量积聚,从而对环境中的各种生物构成威胁。
　　在水产养殖的水体中，蓝藻大量繁殖以及死亡藻类的分解，消耗大量溶解氧，可以导致水体缺氧甚至无氧状态，易导致养殖水体发生泛塘。蓝藻大量死亡时可产生藻毒素、大量羟胺及硫化氢等有毒物质，直接危害水生动物。死亡的蓝藻释放大量的有机质刺激了化能异养细菌的生长，其中部分对养殖动物是致病菌，导致继发感染细菌性疾病。这种情形和虾蟹养殖过程中倒藻引发虾蟹塘发病的情形类似。